Санаторий-профилакторий  КазГАСУ  (КИСИ)  открыт в 1978 году.
     С 20 июня 1979 г. работу санатория-профилактория возглавила Багаутдинова Зайтуна Такеевна, а с 1998 г. она является терапевтом университетского санатория-профилактория.
     В годы работы Багаутдиновой З.Т. санаторий-профилакторий участвовал во Всесоюзном соревновании санаториев-профилакториев и по достигнутым показателям работы в 1986 г. занял  II место, в 1989 г. – III место.
     13 июня 2000 г. Указом Президента РТ за заслуги в области охраны здоровья населения Зайтуне Такеевне было присвоено почётное звание «Заслуженный врач Республики Татарстан».
     В момент открытия в санатории-профилактории было всего два лечебных кабинета: процедурный и физиотерапевтический.
     Постепенно из года в год расширялась лечебная база санатория-профилактория, были введены в строй массажный, стоматологический кабинеты, кабинет теплолечения, подводного массажа, зал лечебной физкультуры.
     С 1998 по 2009 гг. главным врачом санатория-профилактория являлась Шамсутдинова Г.И. За годы её работы, благодаря вниманию и заботе ректората и администрации,  оснащались современной медицинской техникой и оборудованием кабинеты санатория-профилактория; проведён капитальный ремонт помещений.
     Финансирование санатория-профилактория первоначально производилось из фонда социального страхования (ФСС) института. Из-за сокращения отчислений в ФСС в 1997 г. финансирование было уменьшено на 50 %. С ноября 2002 г. ФСС  прекратил частичное финансирование санатория-профилактория и его содержание полностью взял на себя университет. В настоящее время финансирование санатория-профилактория осуществляется за счёт средств федерального бюджета и собственных средств КазГАСУ.