Кафедра теории и истории архитектуры первоначально была основана в 1975 г. Первым заведующим кафедрой был назначен кандидат архитектуры, доцент (в дальнейшем доктор архитектуры, профессор) Айдаров Сайяр Ситдикович, который возглавлял ее дважды - в 1975-1977 и 1980-1983 гг. На кафедре тогда работали: кандидат искусствоведения, доцент Елькович Л.Я. (заведующий кафедрой в 1977-1980 гг.), кандидат архитектуры, профессор Бикчентаев А.Г. (заведующий кафедрой в 1968-1975 гг.), старшие преподаватели Тимербулатов М.Г., Батраев З.С., Рафиков И.В., Попова В.В. и др.
     В 1998 году на базе кафедры были созданы два самостоятельных подразделения: кафедра изобразительных искусств и кафедра основ архитектурного проектирования. Историко-теоретические дисциплины стали преподаваться на созданной в 1990 году кафедре теории, истории и национальных проблем архитектуры.
     Кафедра теории и истории архитектуры была открыта решением Ученого Совета академии от 31 мая 2004 г. Кафедру возглавила декан архитектурного факультета, доктор архитектуры, профессор, советник РААСН Айдарова Галина Николаевна.
     Создание кафедры со специализацией "Теория и история архитектуры" обусловлено необходимостью повышения качества теоретической подготовки выпускников, подготовки научных кадров, разработки актуальных теоретических основ, связанных с развитием архитектуры республики, а также открытием в вузе подготовки бакалавров и магистров архитектуры по направлению 521700 - Архитектура.
     В круг научных интересов кафедры входят: актуальные проблемы теории и истории архитектуры региона, историко-теоретические и методологические аспекты сохранения наследия, а также концептуальное проектирование.